Шест от видовете, установени в района на Лепеница, са сред приоритетните за опазване за цяла Европа: големият и малкият подковоноси, широкоухият прилеп, както и 3 вида нощници: остроухият, големият и трицветният. Пещерата е значимо зимно убежище за поне 3 вида от прилепите, живеещи в региона: големия и малкия подковнос и големия нощник.
Лепеница дава убежище на 7 вида прилепи, които обитават пещерата през различните сезони.
- Голям подковонос – Rhinolophus ferrumequinum
- Малък подковонос – Rhinolophus hipposideros
- Голям нощник – Myotis myotis
- Остроух нощник – Myotis blythii
- Трицветен нощник – Myotis emarginatus
- Широкоух прилеп – Barbastella barbastellus
- Сив дългоух прилеп – Plecotus austriacus
В България се радваме на 33 от срещащите се в Европа 35 вида прилепи. Всички те са строго защитени от Закона за биологичното разнообраззие на територията на цялата страна!