Пещера Леденика е само една от многобройните известни пещери във Врачанския Балкан, които служат като прилепни убежища. Поради ниската температура, пещерата се използва предимно за зимуване.
Леденика дава убежище на общо 4 вида прилепи, които обитават пещерата през различните сезони:
- Голям подковонос – Rhinolophus ferrumequinum
- Малък подковонос – Rhinolophus hipposideros
- Полунощен прилеп - Eptesicus serotinus
- Мустакат нощник – Myotis mystacinus
В България се радваме на 33 от срещащите се в Европа 35 вида прилепи. Всички те са строго защитени от Закона за биологичното разнообразие на територията на цялата страна! Срещащите се в пещера Леденика голям и малък подковонос са сред приоритетните видове за опазване в цяла Европа.